Créée en 1825, l’École Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), la plus ancienne des grandes écoles toulousaines, s’est forgée de longue date une renommée nationale et internationale. C’est l’une des quatre Ecoles nationales vétérinaires françaises (ENVF) et l’un de 12 établissements publics d’enseignement supérieur agronomique, vétérinaire et forestier, sous la tutelle du Ministère de l’Agriculture et de la Souveraineté Alimentaire.
La demande de poste d’assistant(e) ingénieur(e) s’inscrit dans le contexte du développement très important des projets de recherche en virologie clinique.
Cette activité couvre un large champ technique : biologie moléculaire, culture virale, sérologie, séquençage et appui à l’histopathologie moléculaire (technologie d’hybridation in situ et extraction d’acides nucléique à partir d’échantillons fixés et paraffinés).
Dans ce contexte, les objectifs du poste consistent, au sein de l’équipe VIRAL de l’UMR IHAP, à prendre en charge des essais de diagnostic et de recherche en virologie clinique.
Mission 1 : virologie clinique (diagnostic et recherche) : biologie moléculaire et sérologie
Réceptionner, enregistrer et stocker les échantillons selon un protocole de qualité défini, Tenir un cahier d’expériences, rassembler les résultats, les mettre en forme et en rendre compte.
Réaliser, à partir de protocoles définis, des expériences de préparation et d’analyse utilisant un ensemble de techniques, notamment en biologie moléculaire (PCR conventionnelle, PCR temps réel, PCR digitale) et en sérologie (ELISA essentiellement, IHA ou séroneutralisation).
Actualiser le dossier de protocoles techniques.
Missions 2 : métagénomique clinique
Participer à la mise au point et mettre en œuvre les méthodes spécifiques de préparation des acides nucléiques en vue du séquençage NGS (technologie Oxford Nanopore notamment)
Préparer des banques de séquençage NGS, lancement des essais (« runs ») de séquençage.
Sauvegarder des données de séquençage NGS
Mission 3 : missions transversales d’appui à l’activité du laboratoire de virologie clinique
Contribuer à la surveillance des équipements scientifiques, la maintenance de premier niveau et l’entretien du laboratoire
Se former à la mise en œuvre des nouvelles techniques dans le service et initier/accompagner les utilisateurs
Appliquer, en situation de travail, les bonnes pratiques de laboratoire, les règles d’hygiène et de sécurité et celles spécifiques à la manipulation de certains produits
Participer à la gestion des stocks et des commandes
Contraintes du poste
Contraintes d’hygiène et sécurité relatives au travail en L2 et L3.
Travail prolongé sous poste de sécurité microbiologique.
Station debout et/ou assise prolongée.
Savoirs
Connaitre les techniques de biologie moléculaire de base
Bonnes pratiques de laboratoire
Savoir appréhender les risques chimiques et biologiques liés aux produits, matériels et techniques utilisées.
Savoir utiliser les logiciels liés aux techniques expérimentales et à la présentation des résultats.
Comprendre une documentation en anglais
Des notions de NGS, de métagénomique et de sérologie seraient appréciées.
Savoir utiliser les logiciels liés aux techniques expérimentales et à la présentation des résultats.
Comprendre une documentation en anglais
Des notions de NGS, de métagénomique et de sérologie seraient appréciées
Savoir-faire
Organiser et conduire son activité avec rigueur, autonomie et fiabilité
Savoir manipuler dans des conditions stériles et travailler en milieu confiné
Savoir utiliser les équipements de base d’un laboratoire (thermocycleur, microscope, centrifugeuse, spectrophotomètre, balance, …)
Communiquer et collaborer avec les autres parties prenantes d’un projet.
Savoir rendre compte, travailler en équipe
Savoir transférer ses connaissances pour l’accompagnement à l’utilisation d’outils centrifugeuse, spectrophotomètre, balance, …)
Communiquer et collaborer avec les autres parties prenantes d’un projet.
Savoir rendre compte, travailler en équipe
Savoir transférer ses connaissances pour l’accompagnement à l’utilisation d’outils